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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

聚焦脱贫、经济、城乡、生态 内蒙古亮过去五年“成绩单”******

　　中新网呼和浩特1月12日电 (记者 李爱平)1月12日，内蒙古自治区十四届人大一次会议开幕。当天，内蒙古自治区主席王莉霞作政府工作报告时，从脱贫、经济、城乡、生态等多个领域介绍了过去五年内蒙古取得的成绩。

　　王莉霞表示，内蒙古自治区十三届人大一次会议以来的五年，内蒙古举全区之力打赢脱贫攻坚战，157万贫困人口全部脱贫，57个贫困旗县全部摘帽，3681个贫困嘎查村全部出列，历史性地解决了绝对贫困问题，与全国一道共圆小康梦、迈上新征程。

　　王莉霞介绍，过去五年，内蒙古综合经济实力大幅跃升，地区生产总值从1.5万亿元增长到2.2万亿元，人均地区生产总值从6.1万元增长到9.2万元。粮食总产量从全国第十位跃升至第六位，牛奶、羊肉、牛肉和羊绒、饲草产量稳居全国第一。累计生产煤炭53亿多吨、发电2.9万亿度，煤、电保供量均居全国第一。

　　过去五年，内蒙古城乡面貌发生巨大变化。官方介绍，内蒙古城镇化率从64.6%提高到近69%，乡村振兴全面推进，东中西部差异化协调发展格局初步形成。张呼、通新、喀赤高铁相继通车，公路里程增加1.7万公里，呼和浩特新机场主体完工，21个通用机场建设完成，水利、能源、信息等一批重大工程建成投运。

　　过去五年，内蒙古生态环境质量持续改善。官方表示，内蒙古全面完成中央第一轮环保督察及“回头看”整改任务，黄河、“一湖两海”、察汗淖尔等重点河湖流域治理成效显著，破坏草原林地违规违法问题得到有效整治。累计造林3700多万亩、种草1.2亿多亩、防沙治沙5400多万亩，均居全国第一，创建10个国家生态文明建设示范区和8个“绿水青山就是金山银山”实践创新基地。

　　此外，官方还透露，过去五年，内蒙古全面落实党中央疫情防控部署要求，全力处置额济纳、满洲里、二连浩特、呼和浩特等地疫情，最大程度保护了人民群众生命安全和身体健康。坚决整治政府过度举债乱象，重举整治煤炭资源领域违规违法问题，深入推进金融领域改革化险，妥善处置原包商银行、新时代信托风险。扫黑除恶专项斗争圆满收官，社会治安、安全生产、食药安全形势持续向好，社会大局保持稳定。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）